Aloja principalmente obras propiedad de la Diócesis o procedentes de iglesias desacralizadas o de préstamos en comodato.
Situado en los espacios del antiguo Seminario Regional Pontificio, está dividido en dos secciones: Lapidario y Colección Museística.
La primera acoge un conjunto de piezas epigráficas, ornamentales y figurativas, así como una colección de escudos de los obispos de Fano.
La Colección Museística, en cambio, presenta obras de interés histórico, artístico y litúrgico, como relicarios, crucifijos tallados en madera y pintados, lienzos de escuela veneciana, estatuas de madera y ornamentos litúrgicos, además de un báculo de marfil, regalo de Pío V.